ای ایس ایم3 پروٹین ریسرچ میں ایک چھلانگ

ای ایس ایم 3 کی کمپیوٹیشنل طاقت اور بنیادی صلاحیتیں

ای ایس ایم 3 کو دنیا کے سب سے طاقتور جی پی یو کلسٹرز میں سے ایک پر تربیت دی گئی تھی، جس میں 1x10^24 سے زیادہ FLOPS کمپیوٹنگ پاور اور 98 بلین پیرامیٹرز استعمال کیے گئے تھے۔ یہ حیاتیاتی ماڈل کی تربیت میں اب تک کی سب سے بڑی کمپیوٹیشنل سرمایہ کاری کی نمائندگی کرتا ہے۔

ماڈل کی بنیادی طاقت پروٹین کی ترتیب، ساخت اور فنکشن پر بیک وقت کارروائی کرنے کی صلاحیت میں مضمر ہے، جو ان کے آپریشن کو سمجھنے کے لیے ضروری خصوصیات ہیں۔ یہ 3D ڈھانچوں اور افعال کو ایک مجرد حروف تہجی میں تبدیل کرکے حاصل کیا جاتا ہے، جو بڑے پیمانے پر تربیت اور نئی تخلیقی صلاحیتوں کو غیر مقفل کرنے کے قابل بناتا ہے۔

ملٹی موڈل نقطہ نظر: ESM3 ایک ملٹی موڈل نقطہ نظر کو استعمال کرتا ہے، جو اسے ارتقائی نقطہ نظر سے ترتیب، ساخت اور فنکشن کے درمیان گہرے روابط سیکھنے کے قابل بناتا ہے۔
ماسکڈ لینگویج ماڈلنگ: تربیت کے دوران، ESM3 ایک ماسکڈ لینگویج ماڈلنگ مقصد استعمال کرتا ہے۔ یہ جزوی طور پر پروٹین کی ترتیب، ساخت اور فنکشن کو ماسک کرتا ہے اور پھر ماسک والے حصوں کی پیش گوئی کرتا ہے۔ یہ ماڈل کو ان عناصر کے درمیان تعلقات کو گہرائی سے سمجھنے پر مجبور کرتا ہے، اربوں پروٹین اور پیرامیٹرز کے پیمانے پر ارتقاء کی تقلید کرتا ہے۔

ناول پروٹین تیار کرنا اور حقیقی دنیا کی ایپلی کیشنز

ای ایس ایم 3 کی ملٹی موڈل استدلال اسے بے مثال درستگی کے ساتھ نئے پروٹین تیار کرنے کی اجازت دیتا ہے۔ مثال کے طور پر، سائنس دان مخصوص فعال سائٹس کے ساتھ پروٹین اسکیفولڈز بنانے کے لیے ESM3 کی ہدایت کر سکتے ہیں، جس میں ساختی، ترتیب اور فعال ضروریات کو یکجا کیا جاتا ہے۔ اس صلاحیت میں پروٹین انجینئرنگ میں اہم صلاحیت موجود ہے، خاص طور پر ایسے کاموں کے لیے انزائمز ڈیزائن کرنے میں جیسے پلاسٹک کے کچرے کو توڑنا۔

ای ایس ایم 3 کی ایک اہم خصوصیت اس کی پیمانہ کرنے کی صلاحیت ہے، ماڈل کے بڑھنے کے ساتھ ساتھ اس کی مسئلہ حل کرنے کی صلاحیت کو بہتر بنانا۔ مزید برآں، ESM3 خود فیڈ بیک اور لیبارٹری ڈیٹا کے ذریعے خود کو بہتر بنا سکتا ہے، جس سے اس کے تیار کردہ پروٹین کی کوالٹی میں اضافہ ہوتا ہے۔

حقیقی دنیا کی ایپلی کیشنز میں، ESM3 نے پہلے ہی متاثر کن صلاحیتوں کا مظاہرہ کیا ہے۔ مثال کے طور پر، اس نے کامیابی سے ایک نیا سبز فلوروسینٹ پروٹین (esmGFP) تیار کیا جس میں معلوم فلوروسینٹ پروٹین سے صرف 58% ترتیب کی مماثلت تھی۔

esmGFP بریک تھرو: تجرباتی نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ esmGFP کی چمک قدرتی GFP کے مقابلے میں ہے۔ تاہم، اس کا ارتقائی راستہ قدرتی ارتقاء سے مختلف ہے، جو یہ ظاہر کرتا ہے کہ ESM3 قدرتی ارتقاء کے 500 ملین سال سے زیادہ کی تقلید کر سکتا ہے۔